故事始于蜀山脚下的一家客栈，主角李逍遥因误食水魔兽卵而获得特殊体质，随后踏上了一段充满奇幻色彩的冒险旅程。在旅途中，他遇到了神秘少女赵灵儿，并被卷入了苗疆巫术的纷争之中。赵灵儿是女娲后人的转世，肩负着拯救苍生的重要使命。为了保护她，李逍遥不惜一切代价与邪恶势力对抗。
随着剧情的发展，李逍遥与另一位重要女性角色林月如也结下了深厚的情谊。然而，在命运的捉弄下，这段三角关系最终走向悲剧收场。赵灵儿为了解救苍生而献出了自己的生命，林月如则为了救李逍遥而牺牲自我。这两段感情的落幕让无数玩家为之动容。
游戏的结局部分尤为感人，李逍遥带着对两位挚爱的思念继续前行。而游戏中那首经典的插曲《蝶恋》，更是将这份哀伤与不舍表现得淋漓尽致，成为许多人心中难以忘怀的经典旋律。
《仙剑奇侠传1》凭借其扣人心弦的剧情和深刻的人物刻画，至今仍被视为国产游戏史上的巅峰之作。
